Marabotto ingresó por concurso al Poder Judicial en abril de 1960 en calidad de auxiliar y luego fue promovido a oficial, cargos en los que revistó en juzgados de la capital hasta que fue designado Juez de Paz de la 1º Sección Judicial de Artigas el 23/10/64.
Su carrera en la magistratura implicó otros destinos: Juez Letrado de Artigas (10/03/65), fue Juez Letrado de Carmelo ((25/05/66), Juez Letrado de Pando (17/10/69), Juez Letrado de Instrucción de 2º Turno (27/12/71), Juez Letrado de Aduana de 2º Turno (04/02/74), Juez Letrado Civil 17º Turno (18/12/74) y Ministro del Tribunal de Apelaciones en lo Civil de 1º Turno (09/06/81).
Fue designado para integrar la Suprema Corte de Justicia el 30/03/90, cargo que ejerció hasta su cese en marzo de 2000.
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